Главное меню
Главная О сайте Добавить материалы на сайт Поиск по сайту Карта книг Карта сайта
Книги
Аналитическая химия Ароматерапия Биотехнология Биохимия Высокомолекулярная химия Геохимия Гидрохимия Древесина и продукты ее переработки Другое Журналы История химии Каталитическая химия Квантовая химия Лабораторная техника Лекарственные средства Металлургия Молекулярная химия Неорганическая химия Органическая химия Органические синтезы Парфюмерия Пищевые производства Промышленные производства Резиновое и каучуковое производство Синтез органики Справочники Токсикология Фармацевтика Физическая химия Химия материалов Хроматография Экологическая химия Эксперементальная химия Электрохимия Энергетическая химия
Новые книги
Петрянов-соколов И.В. "Научно популярный журнал химия и жизнь выпуск 2" (Журналы)

Петрянов-соколов И.В. "Научно популярный журнал химия и жизнь выпуск 1" (Журналы)

Петрянов-соколов И.В. "Научно популярный журнал химия и жизнь выпуск 12" (Журналы)

Петрянов-соколов И.В. "Научно популярный журнал химия и жизнь выпуск 11" (Журналы)

Петрянов-соколов И.В. "Научно популярный журнал химия и жизнь выпуск 10" (Журналы)
Книги по химии
booksonchemistry.com -> Добавить материалы на сайт -> Биохимия -> Лазуркин Ю.С. -> "Физические методы исследования белков и нуклеиновых кислот" -> 49

Физические методы исследования белков и нуклеиновых кислот - Лазуркин Ю.С.

Лазуркин Ю.С. Физические методы исследования белков и нуклеиновых кислот — М.: Наука, 1967. — 342 c.
Скачать (прямая ссылка): afizsvoystvapentanola1967.djvu
Предыдущая << 1 .. 43 44 45 46 47 48 < 49 > 50 51 52 53 54 55 .. 126 >> Следующая

125
Il I
2 л
V-
t
Л—Л"
„ 4
n n i

о il
i
h
Рис. 3. Схематическое изображение л и л уровней пиримидина (а), пурина (б) и пептидной связи (в). Стрелками указаны длинноволновые я-*-я * и я-»-я * переходы. Точками изображены неподеленные пары электронов
Спектры полинуклеотидов. При образовании из нуклеотидов полимера между нуклеотидами возникают, конечно, химические связи, которые образуются между фосфатными группами и рибозой, не затрагивая азотистых оснований. В то же время спектр в ближнем ультрафиолете обусловлен именно основаниями, поэтому само по себе образование химических связей не должно приводить к изменениям спектра в этой области. Различными опытами было показано, что спектральные изменения не связаны с возникновением водородных связей между основаниями [3, 4]. Поэтому основную роль играет взаимодействие между основаниями вдоль цепи1. Это взаимодействие можно считать диполь-дипольным 2.
Полинуклеотидам присущи два важнейших вида вторичной структуры — упорядоченная спиральная и разупорядоченная клубкообразная. Клубкообразный полимер есть промежуточная форма между отдельными основаниями и спиральным полимером. На обеих стадиях — при образовании клубка из отдельных нуклеотидов и затем при переходе клубок — спираль —был отмечен гипохромный эффект. Итак, при образовании спирального полимера из отдельных мономеров наблюдается гипохромный эффект, причем основная часть эффекта приходится на переход клубок — спираль. Гипохромизм, наблюдаемый при образовании клубкообразного полимера из мономеров, называется остаточным гипохромизмом (З].
1 Взаимодействие вдоль цепи играет основную роль также в стабилизации спиральной структуры [4, 5].
2 Поскольку расстояния между основаниями в ДНК малы, то диполь-ди-польное приближение является весьма грубым. Однако для качественного рассмотрения оно вполне подходит.
126
Проиллюстрируем возможность гипохромного эффекта при переходе клубок — спираль даже без изменения расстояния между осцилляторами на модели димера, состоящего из двух разных осцилляторов. Пусть в «спиральном» состоянии мономеры в димере расположены стопкообразно один под другим в одной плоскости (см. табл. 1, А). При «плавлении» мономеры приобретают возможность вращаться вокруг соединяющей их оси. Зависящий от угла между осцилляторами ер множитель в формуле (18) будет равен (Єаеь) Gab= (eaeb)2=cos2 ср. В «спиральном» состоянии угол ф=0 и cos2 ср=1. В «клубкообразном» состоянии, когда угол может при-- 1
нимать любые значения, cos2 ср = —. Таким образом, в нашем примере при об-
2
разовании «клубка» из отдельных мономеров поглощение длинноволновой полосы уменьшается на некоторую величину, а затем при переходе «клубок — спираль» поглощение вновь уменьшается на такую же величину.
2000
На рис. 4 изображены кривые поглощения ДНК тимуса теленка в клубкообразном (верхняя кривая) и спиральном состояниях. ДНК растворялась в D2O, чтобы продвинуться возможно дальше в коротковолновую область, однако спектры полностью совпадают со спектрами в H2O в той области, где удалось произвести измерения в обычной воде.
Изменение формы кривой и ее смещение весьма незначительны. Основной эффект — значительное уменьшение поглощения при переходе клубок — спираль во всей исследованной области. Этот гипохромный эффект обусловлен взаимодействием наблюдаемых полос с более коротковолновыми при стопкообразном расположении соседних вдоль цепи оснований в ДНК (см. табл. 1, А). Действительно, так как основной вклад в поглощение дают я-^л:*-переходы, которые поляризованы в плоскости оснований, то стопкообразное расположение оснований означает стопкообразное расположение осцилляторов. Более коротковолновые полосы должны при этом испытывать ги-перхромный эффект. С другой стороны, осцилляторы, отвечающие п->-я*-переходам, расположены вдоль одной прямой (параллельной оси спирали), так как эти переходы поляризованы перпендикулярно плоскости оснований. Поэтому длинноволновый я->-я*-переход должен испытывать при взаимодействии с более коротковолновыми п-кгт*-переходами гиперхромный эффект. Как видно из рис. 4, слабая я—>-я*-полоса в окрестности 2820 A
2500 Длина волны, I
3000
Рис. 4. Спектры поглощения клубкооб-разной (верхняя кривая) и спиральной (нижняя кривая) ДНК тимуса теленка в D2O [11].
127
действительно, быть может, не участвует в общем уменьшении интенсивности1. Так как я-»я*- и /г-*я*-полосы имеют взаимно перпендикулярные поляризации, то их можно рассматривать независимо. Как видно из формулы (17), ортогональные полосы не взаимодействуют между собой.
д. Спектры полипептидов и белков
В отличие от полинуклеотидов, в полипептидах группа, дающая характерную для полипептида полосу поглощения в окрестности 190 ммк (амидная группа), образуется при поликонденсации аминокислот, так как она является пептидной связью. Поэтому полипептид можно представить в виде полимера, состоящего из мономерных звеньев — амидных групп, связанных между собой через а-углерод:
HHH
I I I
... — амид —С— амид —С— амид —С— . . .
Предыдущая << 1 .. 43 44 45 46 47 48 < 49 > 50 51 52 53 54 55 .. 126 >> Следующая

Авторские права © 2011 BooksOnChemistry. Все права защищены.
Реклама