Главное меню
Главная О сайте Добавить материалы на сайт Поиск по сайту Карта книг Карта сайта
Книги
Аналитическая химия Ароматерапия Биотехнология Биохимия Высокомолекулярная химия Геохимия Гидрохимия Древесина и продукты ее переработки Другое Журналы История химии Каталитическая химия Квантовая химия Лабораторная техника Лекарственные средства Металлургия Молекулярная химия Неорганическая химия Органическая химия Органические синтезы Парфюмерия Пищевые производства Промышленные производства Резиновое и каучуковое производство Синтез органики Справочники Токсикология Фармацевтика Физическая химия Химия материалов Хроматография Экологическая химия Эксперементальная химия Электрохимия Энергетическая химия
Новые книги
Петрянов-соколов И.В. "Научно популярный журнал химия и жизнь выпуск 2" (Журналы)

Петрянов-соколов И.В. "Научно популярный журнал химия и жизнь выпуск 1" (Журналы)

Петрянов-соколов И.В. "Научно популярный журнал химия и жизнь выпуск 12" (Журналы)

Петрянов-соколов И.В. "Научно популярный журнал химия и жизнь выпуск 11" (Журналы)

Петрянов-соколов И.В. "Научно популярный журнал химия и жизнь выпуск 10" (Журналы)
Книги по химии
booksonchemistry.com -> Добавить материалы на сайт -> Биохимия -> Лазуркин Ю.С. -> "Физические методы исследования белков и нуклеиновых кислот" -> 57

Физические методы исследования белков и нуклеиновых кислот - Лазуркин Ю.С.

Лазуркин Ю.С. Физические методы исследования белков и нуклеиновых кислот — М.: Наука, 1967. — 342 c.
Скачать (прямая ссылка): afizsvoystvapentanola1967.djvu
Предыдущая << 1 .. 51 52 53 54 55 56 < 57 > 58 59 60 61 62 63 .. 126 >> Следующая

7 V V у у V Y
V1(OX) ' '
Рис. 9. Диаграмма Миядзява, иллюстрирующая различные типы колебания (полоса Амид 1) антипараллельной кристаллической упаковки вытянутых полипептидных цепей. Стрелки обозначают направление момента перехода при колебании. Знак в кружочке — отклонение вектора вперед ( + ) или за плоскость чертежа (—) [21]
посредством либо химических, либо водородных связей. Согласно общей теории колебаний, в этом случае каждый колебательный уровень расщепляется на четыре подуровня в соответствии с симметрией ячейки, и мы имеем четыре колебательных перехода. Картина смещений атомов из положений равновесия зависит от различия фаз колебаний отдельных пептидных групп. Японский физик Миядзява [21] развил теорию возмущений с учетом взаимодействий слабо связанных между собой и достаточно локализованных пептидных колебаний. Частота колебания v (б, б') зависит как от степени взаимодействия, так и от разности фаз б между движениями атомов пептидных групп одной цепи и разности фаз
144
Ь' колебаний пептидных групп через водородную связь. Таким образом, в нашем случае мы имеем четыре колебания: v (0, 0), V (0, я), V (я, 0), V (л,л), причем первое в инфракрасном спектре не активно. Из диаграммы на рис. 9 сразу можно определить поляризацию любого из компонентов. Полуэмпирический расчет частот показывает, что они различны. В частности, параллельный компонент V (0, л) должен иметь частоту около 1690 см~\ что позволяет обнаружить его, несмотря на малую интенсивность, так как основной сильный компонент v (я, 0) имеет частоту 1630 см~1. Эта особенность отчетливо видна в спектре фиброина шелка и является прямым доказательством наличия соответствующей антипараллельной упаковки полипептидных цепей в структуре данного белка.
С изучением спектров глобулярных белков дело обстоит значительно сложнее. Регулярная структура полипептидной цепи в их молекулах образуется только на небольших участках, причем единое направление, вдоль которого могут быть ориентированы цепи, отсутствует. Поэтому даже если и удастся получить поляризационный спектр кристаллического слоя, интерпретация инфракрасного дихроизма глобулярных белков будет гораздо сложнее, чем фибриллярных. В то же время именно этот параметр может оказаться наиболее чувствительным к различным типам молекул. Расшифровка тонкой структуры основных амидных полос и ее связи с конформацией полипептидных цепей дают основание надеяться, что инфракрасные спектры могут оказаться полезными и для таких сложных молекул.
Инфракрасные спектры нуклеотидов и нуклеиновых кислот. Подобно аминокислотам и пептидам, нуклеотиды могут существовать в различных ионных формах. Количество этих таутомерных форм в нуклеотидах значительно больше, чем для многих простых аминокислот, так как в их молекулах имеются разные Места, в которых возможно присоединение протона. Практически наблюдается сравнительно мало таутомерных форм из-за того, что протонизация в ряде случаев энергетически невыгодна. Однако одновременное существование уже только двух из них значительно осложняет изучение инфракрасных спектров соединений этого класса. Другой трудностью является то, что структурные формулы азотистых оснований гораздо сложнее формул пептидной группы, поэтому в настоящее время описание их нормальных колебаний отсутствует. Это, безусловно, снижает достоверность выводов, полученных на основе полуэмпирической интерпретации основных полос поглощения, и ограничивает информацию, которая в принципе могла бы быть извлечена из спектров. Так же, как и в случае белков, приближенная интерпретация основных групповых частот в инфракрасных спектрах нуклеиновых кислот была сделана на основании изучения поглощения отдельных атомных группировок в низкомолекулярных
10 Физические методы исследования белков
145
Рис. 10. Поляризационный спектр пленки литиевой соли ДНК при разных относительных влажностях а— 8й%; 6—15% [22]. Сплошная и пунктирная линии имеют тот же смысл, что на рис. 8
I .
соединениях. В отличие от спектров белков, спектры нуклеиновых кислот характеризуются колебаниями не одной, а нескольких основных групп атомов.
На рис. 10 представлен инфракрасный спектр литиевой соли дезоксирибонуклеиновой кислоты (Li ДНК). Сильные полосы валентных колебаний NH, ОН и структурной воды находятся в области 3500—3000 см~х. Полосы в области 1750—1550 см~1 обусловлены так называемыми колебаниями кратных связей СО, CN, CC Точная форма этих колебаний, относящихся к плоским колебаниям атомов колец азотистых оснований, неизвестна. Из изучения спектров простых молекул следует, что в этой области находятся колебания, связанные с растяжением сопряженных связей указанного типа. Две сильные полосы с частотами максимумов около 1240 и 1080 см~1 обусловлены антисимметричным'и симметричным колебаниями заряженной группы PO2, при которых изменяются наибольшим образом длины связей PO. Все другие колебания имеют полосы гораздо слабее по интенсивности, и надежная интерпретация их сейчас отсутствует.
Поляризация основных полос поглощения в спектре ДНК позволяет получить сведения о пространственной ориентации плоскостей азотистых оснований и расположении фосфатных групп. Эти данные не противоречат известной спиральной модели молекулы, предложенной Уотсоном и Криком. Дихроизм основных полос зависит от влажности среды, в которой находится полимерная пленка. При этом различные характеристики полос
Предыдущая << 1 .. 51 52 53 54 55 56 < 57 > 58 59 60 61 62 63 .. 126 >> Следующая

Авторские права © 2011 BooksOnChemistry. Все права защищены.
Реклама