Главное меню
Главная О сайте Добавить материалы на сайт Поиск по сайту Карта книг Карта сайта
Книги
Аналитическая химия Ароматерапия Биотехнология Биохимия Высокомолекулярная химия Геохимия Гидрохимия Древесина и продукты ее переработки Другое Журналы История химии Каталитическая химия Квантовая химия Лабораторная техника Лекарственные средства Металлургия Молекулярная химия Неорганическая химия Органическая химия Органические синтезы Парфюмерия Пищевые производства Промышленные производства Резиновое и каучуковое производство Синтез органики Справочники Токсикология Фармацевтика Физическая химия Химия материалов Хроматография Экологическая химия Эксперементальная химия Электрохимия Энергетическая химия
Новые книги
Сидельковская Ф.П. "Химия N-вннилпирролидона и его полимеров" ()

Райт П. "Полиуретановые эластомеры" (Высокомолекулярная химия)

Сеидов Н.М. "Новые синтетические каучуки на основе этилена и олефинов" (Высокомолекулярная химия)

Поляков А.В "Полиэтилен высокого давления. Научно-технические основы промышленного синтеза" (Высокомолекулярная химия)

Попова Л.А. "Производство карбамидного утеплителя заливочного типа" (Высокомолекулярная химия)
Книги по химии
booksonchemistry.com -> Добавить материалы на сайт -> Биохимия -> Саратиков А.С. -> "Регуляторы ферментативных систем детоксикации среди азотсодержащих соединений " -> 40

Регуляторы ферментативных систем детоксикации среди азотсодержащих соединений - Саратиков А.С.

Саратиков А.С., Ахмеджанов Р.Р., Бакибаев А.А. Регуляторы ферментативных систем детоксикации среди азотсодержащих соединений — Томск, 2002. — 264 c.
Скачать (прямая ссылка): regulyatorifermentnihsistem2002.djvu
Предыдущая << 1 .. 34 35 36 37 38 39 < 40 > 41 42 43 44 45 46 .. 75 >> Следующая

С помощью метода ПНК строятся линейные модели вида (10):
1^ ^ = '^jaflZh ^
/2=1
(с)
где / - вычисленная биологическая активность; ah~ РеГ_
рессионный коэффициент перед скрытой переменной Zh.
Выбор количества скрытых переменных Н проводится, во-первых, по величине сохраняемой информации, рассчитываемой как доля дисперсии исходных координат, остающаяся в новом базисе. Во-вторых, для выбора Н выполняется процедура скользящего контроля, т.е. поочередное отбрасывание одного соединения серии и предсказание его биологической активности по модели, построенной на основе остальных соединений. Таким образом, регрессионная модель (10) характеризуется среднеквадратичной неточностью Sm получаемой при скользящем контроле, долей сохраняемой информации Р, дисперсией адекватности S2 и множественным коэффициентом корреляции R. Вместо среднеквадратичного отклонения Scv для оценки качества прогноза активности при скользящем контроле в публикациях
по КССА применяют также величину R^ [207,214,225,226]:
С2
о 2 _ 1 _ *->су
cv г-2 , (11)
ser
2
где Sser - дисперсия значений биологической активности внутри исследуемой серии веществ.
Важное достоинство метода ФМ связано с тем, что фрагменты могут быть «строительными блоками» новых лигандов и для химика ассоциируются с определёнными типами синтонов. Множество ОПН и коэффициенты or* позволяют оценить вклад каждого жёсткого фрагмента в возникновение биологического эффекта. Хотя регрессоры Z/> не имеют ясного физического смысла, они являются линейными комбинациями (12) первоначальных регрессоров Хк:
где Д./, - коэффициент, отражающий вклад величины Хк в скрытую переменную Z*; Хк - среднее значение^. для молекул серии. Роль Хк играет количество отнесений к к-му ЦА, т.е. элемент соответствующего столбца матрицы V. Коэффициенты Д* определяются в методе ПНК наряду с остальными характеристиками линейных моделей и делают возможным переход от базиса скрытых переменных к первоначальному многомерному базису [222]. Тогда уравнение (10) приводится к виду (13), где коэффициенты Ак имеют однозначную интерпретацию и отражают степень влияния каждого ЦА на биологическую активность:
К _ Н К Н К
j{c) = -'?Xk'?jahPkh +Y^Xk'EJCChPkh =AQ + YjAkXk. (13) k=1 h= 1 k=\ h=1 k=1
Теперь вклад г-го ОПН у-го лиганда в сумму (13) можно выразить уравнением (14):
п ¦ К
(14)
где n0i - количество отнесений в г-м ОПН; N, - количество отнесений во всех ОПНу'-го лиганда; - количество отнесений к к-му ЦА в г-м ОПН.
Суммируя со, по наложениям, построенным с участием /-го фрагмента у'-го лиганда, получим вес этого фрагмента Wj/. Значения Wjj обладают свойством аддитивности, т.е. выполняется условие:
I'fy-'f. (15)
/
Нахождение весов W)i представляет собой попытку разложить биологический эффект соединения на эффекты структурных единиц, образующих его молекулу. Такого рода инкременты весьма полезны для целенаправленного дизайна соединений с заданными свойствами.
3.3. Количественные соотношения «структура—активность» в ряду триазинов Бейкера — ингибиторов дигидрофолатредуктазы
Для проверки возможностей метода ФМ в качестве тестового был выбран [220] ряд триазинов Бейкера 1-26 (рис. 46), являющихся ингибиторами дигидрофолатредуктазы и подвергавшихся ранее [212,213] непрямому ЗБ-КССА-анализу. Это позволило сравнить метод ФМ с другими известными подходами. Авторы работ [212,213] строили «супермолекулы», совме-
1-33
Рис. 46. Триазины Бейкера, исследованные методом ФМ. 1:R1=R4=H, R2=R3=CI; 2: R1=R3=R4=H, R2=(CH2}2CfH5; 3:R1=R2=R?=H, R3=CH2C6H5>- 4: Ri=R*=R*=H, R2=CH2C5: R1= R2=R4=H, R3=(CHJ2C6H^ 6: R1=R3=R4=H, R2=CF3; 7: R1= R3=R4=H, R2=CI; 8: R1=R4=H, R2=CI, R3=OCH2C6H5; 9: R1= R3=R4=H, R^SOf; 10: R,=R4=H, R2=C/75, R3=OH; 11. R1= r3=r4=h, R2=N02; 12: R*=R2=R4=H, R3=CH2CN; 13: R1= R2=R3=R4=H; 14: R'=R3=R4=H, R2=C6H5; 15: R'=R?=R*=H, R2=COCH3; 16: R1=R2=CI, R3=R?=H; 17: R’=R2=R<=H, R3=COCH2CI; 18: R’=R3=R4=H, R2=COCH2CI; 19: R’=R3=R*=H, R2=OCHy 20: R1=R2=R*=H, R3=CN; 21: R1=F, R2=R3=R4=H; 22: R1=R2=R4=H, R3=C6H5; 23: R1=Br, R2=R3=R?=H; 24: R1=CI, R2=R3=R?=H; 25: R1=OCH3, R2=R3=R4=H; 26: R’=R4=C/, R2=R3=H; 27: R1=CH3, R2=R3=R4=H; 28: R^R3=R4=H, R2=S02NH2; 29: R’=R3=R4=H, R2=CONH2; 30: R1=R3=R4=H, R2=OH; 31: R1=R3=R4=H, R2=F; 32: R1=R3=R4=H, R2=C(CH3)3; 33: Ri=R3=R4=H, R2=CN.
щая трёхмерные модели лигандов до наилучшего перекрывания ван-дер-ваальсовых объёмов, и получали регрессионные уравнения на основе различных характеристик «супермолекул». Указанная выборка включает соединения с разными типами внутренних вращательных степеней свободы и является в этом смысле представительной [213] для многих известных триази-нов Бейкера.
Предыдущая << 1 .. 34 35 36 37 38 39 < 40 > 41 42 43 44 45 46 .. 75 >> Следующая

Авторские права © 2011 BooksOnChemistry. Все права защищены.
Реклама