Главное меню
Главная О сайте Добавить материалы на сайт Поиск по сайту Карта книг Карта сайта
Книги
Аналитическая химия Ароматерапия Биотехнология Биохимия Высокомолекулярная химия Геохимия Гидрохимия Древесина и продукты ее переработки Другое Журналы История химии Каталитическая химия Квантовая химия Лабораторная техника Лекарственные средства Металлургия Молекулярная химия Неорганическая химия Органическая химия Органические синтезы Парфюмерия Пищевые производства Промышленные производства Резиновое и каучуковое производство Синтез органики Справочники Токсикология Фармацевтика Физическая химия Химия материалов Хроматография Экологическая химия Эксперементальная химия Электрохимия Энергетическая химия
Новые книги
Сидельковская Ф.П. "Химия N-вннилпирролидона и его полимеров" ()

Райт П. "Полиуретановые эластомеры" (Высокомолекулярная химия)

Сеидов Н.М. "Новые синтетические каучуки на основе этилена и олефинов" (Высокомолекулярная химия)

Поляков А.В "Полиэтилен высокого давления. Научно-технические основы промышленного синтеза" (Высокомолекулярная химия)

Попова Л.А. "Производство карбамидного утеплителя заливочного типа" (Высокомолекулярная химия)
Книги по химии
booksonchemistry.com -> Добавить материалы на сайт -> Биохимия -> Саратиков А.С. -> "Регуляторы ферментативных систем детоксикации среди азотсодержащих соединений " -> 50

Регуляторы ферментативных систем детоксикации среди азотсодержащих соединений - Саратиков А.С.

Саратиков А.С., Ахмеджанов Р.Р., Бакибаев А.А. Регуляторы ферментативных систем детоксикации среди азотсодержащих соединений — Томск, 2002. — 264 c.
Скачать (прямая ссылка): regulyatorifermentnihsistem2002.djvu
Предыдущая << 1 .. 44 45 46 47 48 49 < 50 > 51 52 53 54 55 56 .. 75 >> Следующая

При целенаправленном конструировании новых веществ наибольший интерес обычно представляют разнородные соединения, заметно отличающиеся по строению от известных веществ, обладающих заданным свойством. С другой стороны, молекулы, близкие по свойствам, часто содержат одинаковые структурные фрагменты. По-видимому, для близости свойств химических соединений фундаментальное значение имеет определённый порядок сочленения похожих фрагментов в их МГ, важный для процессов молекулярного распознавания. Исходя из вышесказанного, перспективен подход к созданию новых соединений по результатам изучения взаимосвязи «структура-свойство», основанный на оптимальном построении новых молекул из фрагментов, первоначально содержавшихся в известных соединениях с заданным свойством. Допустим, что мерой сходства фрагментов являются характеристики, близкие между собой для химически разнородных структур и важные с точки зрения молекулярного распознавания (например, липофильность и молярный объём [250]). Тогда, имея достаточно широкий набор фрагментов, можно сконструировать соединения, сходные по этим характеристикам, но разнообразные по химической природе. В целевых молекулах окружение каждого фрагмента должно быть близко к таковому в известных веществах, т.е. оптимизацию структуры следует проводить на локальном уровне. Нами разработан и апробирован соответствующий алгоритм конструирования [251].
Каждому из исследуемых соединений сопоставим моле-кулярный граф G. Множество атомов (вершин графа G) разобьем на L непересекающихся подмножеств, которые порождают в G подграфы фрагментов G/ (/=1,1). Разбиение выполним таким образом, чтобы химическим связям, соединяющим атомы разных фрагментов, соответствовали некоторые ребра Г/т, принадлежащие множеству мостов графа G [252]. Вершины, инцидентные ребрам пт, и соответствующие им атомы будем называть граничными. При описании алгоритма конструирования можно принимать во внимание только множества F/, состоящие из граничных вершин уц (i= UK) подграфов G/, и мосты г!т, представив химическое соединение в виде гиперграфа Н, ребрами которого являются F/ и r/m (подробнее о гиперграфах см. [252,253]). Если граничный атом /-го фрагмента соединен одновременно с к соседними фрагментами, то пусть ему соответствуют к вершин ребра Fh инцидентных одному мосту rim каждая. Молекулярный гиперграф (МГГ) не содержит циклов, и все его вершины имеют степень 2 (см. пример на рисунке 58). Множество вершин VH и множество
ребер ЕН гиперграфа Н=( VH, ЕН) определяются следующим
L
образом: VH= U-^/» ЕН= {F1,F2,...,Fl}kjRH^ где есть
(.?,-1)-элементное множество, состоящее из мостов
fim~{vu,vmj}. Ребра Fi - образы подграфов G/ - для простоты тоже будем называть фрагментами.
Рассмотрим последовательность функций dk( Н(/))
(к=\,К), ставящих в соответствие однореберному гиперграфу HW=(F/,{F/}) набор из К дескрипторов (свойств) l-го молекулярного фрагмента. Допустим, что каждое свойство 188
G2
Рис. 58. Представление химической структуры молекулярным гиперграфом на примере З-метил-З-фенил-5-(2-хлорвинил)циклогексанона. Молекулярные фрагменты Gi, G2, G5 отображаются в множества Fb F2, ..., F5, которые вместе с мостами г12, г14, г15, г2з образуют множество ребер ЕН гиперграфа. Четвертичный атом углерода из фрагмента Gi имеет два заместителя (фрагменты G4 и G5). Этому атому соответствуют две вершины (v12 и v13) ребра Fb
является аддитивным, т.е. для любого подгиперграфа Н', содержащегося в Н, выполняется условие (1):
При этом дескрипторы ребер r/m принимаются равными нулю. Каждой вершине Уц поставим в соответствие К действительных меток gk(vn) = dk (Н'/;), где Н'/;- не содержащая уц связная компонента гиперграфа, полученного из Н удалением моста rim, инцидентного v/;. Например, для МГГ на рисунке 58 в состав Н'д входят следующие множества ребер: EH\\={F2,
dt(Н’)= 2Х(Н(,)) .
(1)
F.eEH'
Таким образом, метка g^(v//) представляет собой к-е свойство заместителя у одного из граничных атомов 1-го фрагмента. Состав заместителя отражается подгиперграфом Н’/;. Значения gkiyn) определяются один раз для фрагментов в составе исходных химических соединений и используются затем при вычислении критерия оптимальности (2) новых структур, получаемых из этих фрагментов.
х<н>=Н ? Е"А<н'*>-г*М2, (2)
\УП\ vueVH к = 1
где Н' _ подгиперграфы, содержащиеся в новом гиперграфе Н;
Wk - весовые коэффициенты дескрипторов.
Задача конструирования молекул сводится к построению гиперграфов Н, имеющих невысокие значения 5(H), из конечного набора ребер Ft (t=l,T). В этом случае новые соединения окажутся близки к исходным в смысле окружения фрагментов. Кроме того, подобие свойств, описываемых функциями dk(Н), будет иметь место и для молекул в целом ввиду аддитивности этих свойств.
Соединяя фрагменты F/ мостами r/m, на промежуточных этапах решения мы получим «незавершенные» гиперграфы Н с одной или несколькими висячими вершинами, не имеющими инцидентных ребер Множество таких вершин обозначим через Л(Н). Каждый цикл конструирования состоит в наращивании гиперграфа на один фрагмент с оптимальным присоединением его мостом к одной из висячих вершин. Поэтому необходимо обобщить критерий оптимальности 5(H), сделав его применимым к незавершенным гиперграфам:
Предыдущая << 1 .. 44 45 46 47 48 49 < 50 > 51 52 53 54 55 56 .. 75 >> Следующая

Авторские права © 2011 BooksOnChemistry. Все права защищены.
Реклама